MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	TCTT	2	8	110	117	0 %	75 %	0 %	25 %	166153974
2	NC_010287	GAA	2	6	139	144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153974
3	NC_010287	AG	3	6	147	152	50 %	0 %	50 %	0 %	166153974
4	NC_010287	AG	3	6	201	206	50 %	0 %	50 %	0 %	166153974
5	NC_010287	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153974
6	NC_010287	A	6	6	262	267	100 %	0 %	0 %	0 %	166153974
7	NC_010287	ACA	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153974
8	NC_010287	TTGT	2	8	305	312	0 %	75 %	25 %	0 %	166153974
9	NC_010287	A	7	7	330	336	100 %	0 %	0 %	0 %	166153974
10	NC_010287	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153974
11	NC_010287	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153974
12	NC_010287	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153974
13	NC_010287	CATG	2	8	468	475	25 %	25 %	25 %	25 %	166153974
14	NC_010287	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153974
15	NC_010287	ATG	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153974
16	NC_010287	TC	3	6	579	584	0 %	50 %	0 %	50 %	166153974
17	NC_010287	TTC	2	6	636	641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153974
18	NC_010287	AAG	2	6	695	700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153974
19	NC_010287	GAA	3	9	724	732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153974
20	NC_010287	TGA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153974
21	NC_010287	GA	3	6	792	797	50 %	0 %	50 %	0 %	166153974
22	NC_010287	GGT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153974
23	NC_010287	GCT	2	6	856	861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166153974
24	NC_010287	GGT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153974
25	NC_010287	AAAG	2	8	883	890	75 %	0 %	25 %	0 %	166153974
26	NC_010287	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153974
27	NC_010287	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153974
28	NC_010287	AG	3	6	920	925	50 %	0 %	50 %	0 %	166153974
29	NC_010287	GCTA	2	8	975	982	25 %	25 %	25 %	25 %	166153974
30	NC_010287	GA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	50 %	0 %	166153974
31	NC_010287	GAA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153974
32	NC_010287	GCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010287	GAG	2	6	1047	1052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153975
34	NC_010287	GCGTA	2	10	1071	1080	20 %	20 %	40 %	20 %	166153975
35	NC_010287	TCT	2	6	1149	1154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153975
36	NC_010287	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153975
37	NC_010287	TAA	3	9	1216	1224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153975
38	NC_010287	AAT	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153975
39	NC_010287	CATG	2	8	1294	1301	25 %	25 %	25 %	25 %	166153975
40	NC_010287	TATCCA	2	12	1306	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153975
41	NC_010287	A	6	6	1338	1343	100 %	0 %	0 %	0 %	166153975
42	NC_010287	AGAT	2	8	1346	1353	50 %	25 %	25 %	0 %	166153975
43	NC_010287	AGGA	2	8	1424	1431	50 %	0 %	50 %	0 %	166153975
44	NC_010287	TATGG	2	10	1436	1445	20 %	40 %	40 %	0 %	166153975
45	NC_010287	TC	3	6	1446	1451	0 %	50 %	0 %	50 %	166153975
46	NC_010287	TCT	2	6	1470	1475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153975
47	NC_010287	T	6	6	1475	1480	0 %	100 %	0 %	0 %	166153975
48	NC_010287	GAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153975
49	NC_010287	AGG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153975
50	NC_010287	TGT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153975
51	NC_010287	ACA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153975
52	NC_010287	TTTCG	2	10	1720	1729	0 %	60 %	20 %	20 %	166153975
53	NC_010287	TGA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153975
54	NC_010287	TG	3	6	1790	1795	0 %	50 %	50 %	0 %	166153975
55	NC_010287	GTCT	2	8	1837	1844	0 %	50 %	25 %	25 %	166153975
56	NC_010287	CAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153975
57	NC_010287	TAA	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153975
58	NC_010287	TCT	2	6	1920	1925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153975
59	NC_010287	GAA	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153975
60	NC_010287	A	6	6	1933	1938	100 %	0 %	0 %	0 %	166153975
61	NC_010287	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153975
62	NC_010287	GAG	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153975
63	NC_010287	TTTG	2	8	2044	2051	0 %	75 %	25 %	0 %	166153975
64	NC_010287	CCTT	2	8	2067	2074	0 %	50 %	0 %	50 %	166153975
65	NC_010287	CTT	3	9	2150	2158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153975
66	NC_010287	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	166153975
67	NC_010287	A	6	6	2245	2250	100 %	0 %	0 %	0 %	166153975
68	NC_010287	CAG	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153975
69	NC_010287	AAGG	2	8	2314	2321	50 %	0 %	50 %	0 %	166153975
70	NC_010287	AAC	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153975
71	NC_010287	T	8	8	2478	2485	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
72	NC_010287	T	7	7	2491	2497	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
73	NC_010287	GAG	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153976
74	NC_010287	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
75	NC_010287	CTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153976
76	NC_010287	T	6	6	2591	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
77	NC_010287	ATT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153976
78	NC_010287	T	6	6	2746	2751	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
79	NC_010287	T	6	6	2758	2763	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
80	NC_010287	GTC	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	166153976
81	NC_010287	AGG	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	166153976
82	NC_010287	AG	3	6	2843	2848	50 %	0 %	50 %	0 %	166153976
83	NC_010287	T	6	6	2872	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	166153976
84	NC_010287	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153976
85	NC_010287	TAA	3	9	2920	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010287	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010287	T	6	6	2963	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010287	ATC	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153977
89	NC_010287	T	7	7	3060	3066	0 %	100 %	0 %	0 %	166153977
90	NC_010287	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153977
91	NC_010287	A	6	6	3131	3136	100 %	0 %	0 %	0 %	166153977
92	NC_010287	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153977
93	NC_010287	GAGAA	2	10	3215	3224	60 %	0 %	40 %	0 %	166153977
94	NC_010287	CT	4	8	3235	3242	0 %	50 %	0 %	50 %	166153977
95	NC_010287	ACA	2	6	3259	3264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153977
96	NC_010287	A	7	7	3303	3309	100 %	0 %	0 %	0 %	166153977
97	NC_010287	TGCTT	2	10	3396	3405	0 %	60 %	20 %	20 %	166153977
98	NC_010287	TCA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153977
99	NC_010287	GGT	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153977
100	NC_010287	TTG	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153977
101	NC_010287	AAG	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
102	NC_010287	AGC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153977
103	NC_010287	TGG	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153977
104	NC_010287	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
105	NC_010287	TGG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	166153977
106	NC_010287	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	166153977
107	NC_010287	TCT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153977
108	NC_010287	ATG	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	166153977
109	NC_010287	AAG	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
110	NC_010287	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	166153977
111	NC_010287	TCA	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153977
112	NC_010287	TTG	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153977
113	NC_010287	TGT	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153977
114	NC_010287	CT	3	6	4096	4101	0 %	50 %	0 %	50 %	166153977
115	NC_010287	TC	3	6	4140	4145	0 %	50 %	0 %	50 %	166153977
116	NC_010287	AGA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
117	NC_010287	CAA	2	6	4223	4228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	166153977
118	NC_010287	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
119	NC_010287	A	7	7	4299	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	166153977
120	NC_010287	AGC	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	166153977
121	NC_010287	TTTG	2	8	4348	4355	0 %	75 %	25 %	0 %	166153977
122	NC_010287	AAG	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
123	NC_010287	TGCT	2	8	4430	4437	0 %	50 %	25 %	25 %	166153977
124	NC_010287	A	6	6	4492	4497	100 %	0 %	0 %	0 %	166153977
125	NC_010287	GTTT	2	8	4578	4585	0 %	75 %	25 %	0 %	166153977
126	NC_010287	TAT	2	6	4586	4591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	166153977
127	NC_010287	AAG	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
128	NC_010287	CAGC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	25 %	50 %	166153977
129	NC_010287	AG	3	6	4670	4675	50 %	0 %	50 %	0 %	166153977
130	NC_010287	AGA	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
131	NC_010287	GAA	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
132	NC_010287	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	166153977
133	NC_010287	AAAC	2	8	4737	4744	75 %	0 %	0 %	25 %	166153977
134	NC_010287	AGA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
135	NC_010287	AG	3	6	4848	4853	50 %	0 %	50 %	0 %	166153977
136	NC_010287	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	166153977
137	NC_010287	AATC	2	8	4896	4903	50 %	25 %	0 %	25 %	166153977
138	NC_010287	GTT	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	166153977
139	NC_010287	ACTGT	2	10	5098	5107	20 %	40 %	20 %	20 %	166153977
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